在當前背景下,科研能力和學術水平可以體現出一所醫(學)院的社會地位。雖然已經有人提出應當破除“唯SCI論”的觀點。但是根據當前的大環境來看,這種觀點一時半會還不能被大眾接受。所以說一個不做科研、沒有文章的醫生會降低自己的競爭力。而想要有一篇屬于自己的SCI文章,首先得有一個好的科研思路。我相信大家每當提到科研思路,都會有點苦惱,尤其是碰到放養型導師時,尤為明顯。在這里,我為大家介紹一下一個優秀的科研思路是如何誕生的。
老生常談讀文獻
相信你每次去詢問導師關于科研的問題,導師最后總是親切的回復你一句:多讀文獻(自己學)。那為什么我們要去讀文獻呢?一開始我讀文獻的原因可能是因為別人都這么做吧,因為在我們周圍的醫生、博導、碩導、同門師兄弟們,全部需要在科研論文研究過程中讀大量文獻。但是經過幾年的磨練,我發現事情沒那么簡單。

首先對于我們來說,想要去做科研,得先知道我們所研究領域的現狀怎么樣。看文獻就是最直接有效的辦法。所研究領域的現狀主要集中在綜述、基礎實驗的Introduction和discussion部分。讀完這三部分后,就對整個領域有一個大體的認識。除此之外,在剛邁進科研領域的大門時,研究方法,主要是實驗方法成為我們科研路上的絆腳石。但是通過閱讀文獻,我們可以知道哪些實驗是比較常見的、做這些實驗的目的和意義是什么。當我們獲得這些知識時,可以說是半只腳踏過科研的門檻。最后我想談談基礎實驗中的result部分。這個部分可以說是整篇文章的靈魂了,其目的是為了呈現研究的主要結果。結果部分反映了論文的水平和價值,也是我們獲得科研思路的重要來源。對于科研老手來講,可能只需要看這一部分就夠了。
總之,大量閱讀文獻是碩士乃至博士開啟科研之旅的必經之路。雖然,讀文獻的過程枯燥、難懂,讓人真的很難讀下去,并且大家經常會讀到后面就忘了前面講的是什么。但是我們仍要堅持下去。

基礎實驗的科研思路如何誕生?
現代科研的基本模式是假說驅動的,而科研假說主要滿足科學性、明確性、邏輯性和創新性。我認為其中最重要的就是創新性。以臨床基礎研究為例,其目標為尋找疾病的新機制(關鍵分子)、藥物新機理、診療的新策略。通過閱讀了大量的文獻,我把科研課題的要素組成提煉為一個公式:A基因通過調控B(機制)在C中(疾病、細胞、動物模型)發揮D作用。可以看出一般的科研課題涉及這四要素。但是這四種要素并不一定會全部出現在一篇文章中。這么說可能有點抽象,我舉幾個例子。


這兩個例子是我挑出來的,題目比較明顯。在這兩篇文章題目中[1, 2]就充分的體現了文章的四要素:第一篇文章是在2019年發表的,GATA3(A基因)通過抑制Slug(B機制)增加肝細胞癌C中(疾病、細胞、動物模型)的侵襲性(D發揮作用)。表達第二篇文章是2021年11月發表的,在乳腺癌C中(疾病、細胞、動物模型)中,GATA3(A基因)通過結合下游BRCA1(B機制)抑制EMT(D發揮作用)。通過兩篇文章,我們不難發現兩者的相似之處。這也就引出創造科研思路或者課題的第一種辦法:貍貓換太子。像上面兩個例子。作者利用的是同種關鍵分子GATA3。按照總結的公式來講。后者將肝細胞癌的研究轉戰到自己研究的乳腺癌中。并且對于新的機制進行了探索,至于后面的研究該怎么展開,只需做相應的預實驗就可以了。這種提出新的科研思路的方法是最普遍的,因為上述的A、B、C、D四種都是可以換的。這時,可能會有人可能會問一個關鍵問題:這樣還算創新嗎?明確的告訴你:算!而且這種方法簡單易上手,大家都在用。
不知道大家在閱讀文獻的討論部分時會不會看到這樣的一句話:由于XX機制尚不明確,需要對XX進行進一步研究。其實,作者的這句話往往就暗示了另一種科研思路。在公式中,往往體現出缺少B機制的要素。下面我來給大家介紹第二種方法,探索尚未發現的機制。挖掘尚未發現的機制機理對科研人員有一個比較高的要求,不僅要對這個領域比較重要的科學技術問題了如指掌,還要對這個領域所有新進展保持敏感性。結合自己的問題,可能會發現很多、很棒的思路。我們還拿GATA3舉例。

這篇文章[3]發表在很早的年份2004年,作者在對人類乳腺腫瘤的基因芯片分析中,發現無論是正常乳腺腔上皮還是雌激素受體(ESR1)陽性的腫瘤都顯示出GATA3的高表達。然后作者經過一系列的實驗證明:GATA3參與了上皮細胞的生長控制和分化狀態的維持,GATA3變異可能會導致ESR1陽性乳腺腫瘤的發生。從這篇文章中就不難總結出幾個科研思路。第一,GATA3通過什么樣的機制參與了上皮細胞的生長控制和分化狀態的維持?第二,既然是上皮細胞的生長控制和分化狀態,那么其他的腫瘤呢?第三,GATA3對具體腫瘤發生,腫瘤微環境,腫瘤遷移等等有什么樣的影響?這樣幾個有創意的科研思路不就有了嗎?

就是這么簡單,在2004年的那篇文章過去九年之后,2013就出現了這篇《在乳腺癌中發現的 GATA3 突變可能與異常的核定位、減少的反式激活和細胞侵襲性有關》的文章,探索了其發生作用的可能機制。

所以說閱讀一篇文章,要思考這篇文章有沒有可以深入或者拓展的地方,這樣就會獲得一個屬于自己的idea。當然也得考慮自己idea的可行性。這就需要和導師商量了,因為他是出錢的那個呀。當然最好可以咨詢專業大佬的意見。
既然開始搞科研了,不能只憑著熱情。做某個項目前就把大局觀培養出來,能夠通過多個角度去看待問題。最后為大家介紹這種獲得科研思路的方式是最正統和最有意義的。那就是在臨床和科研中,你切實發現了某種問題,并且想去解決。提出了這樣一個假設后,需要去閱讀大量文獻去求證自己的想法。在這個基礎上,你自然有了對科研思路評價的能力。然后要讓自己的想法變得再簡單一些,靜下心來做不跟風、有價值的研究工作。思路對了,就一定能做出自己想要的東西。這樣就可以摸索出屬于自己的思路與風格。科學研究終究是發現真理的過程!
不想做基礎實驗,或者沒有相應的條件怎么辦?
在我們的研究中,回顧性研究也占有一席之地。它是從以往臨床工作積累的病例資料中,選擇某一時期同類臨床資料進行整理、分析,以從中總結經驗、找出規律、指導實踐的研究。其優點就是不需要做實驗。簡單易上手。其對應的思路也是簡單粗暴,無非就是以下幾點
另外,近年來生信分析可謂炙手可熱,常規的生信分析思路,主要包括差異基因的篩選、功能富集分析、基因表達水平的檢驗以及預后模型的建立和評估。借助生信的方式,可以助力你的回顧性研究。
寫在最后的話:差點忘記獲得優秀科研思路重要的方法,關注生信人公眾號,每日為您奉獻精品思路哦~
參考文獻
[1] F. Bai, L.H. Zhang, X. Liu, C. Wang, C. Zheng, J. Sun, M. Li, W.G. Zhu, X.H. Pei, GATA3 functions downstream of BRCA1 to suppress EMT in breast cancer, Theranostics, 11 (2021) 8218-8233.
[2] Z. Zhang, X. Fang, G. Xie, J. Zhu, GATA3 is downregulated in HCC and accelerates HCC aggressiveness by transcriptionally inhibiting slug expression, Oncol Lett, 21 (2021) 231.
[3] J. Usary, V. Llaca, G. Karaca, S. Presswala, M. Karaca, X. He, A. Langerod, R. Karesen, D.S. Oh, L.G. Dressler, P.E. Lonning, R.L. Strausberg, S. Chanock, A.L. Borresen-Dale, C.M. Perou, Mutation of GATA3 in human breast tumors, Oncogene, 23 (2004) 7669-7678.