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小伙伴們好久不見，我是你們本期的熱點講解員Eric。
今年3月國自然基金申請大家都準備的怎么樣了呢，是胸有成竹，還是忐忑不安？這不，小編給大家帶來了新一期的熱點解讀——外泌體(exosome)。
想必大家對外泌體已經不陌生了，CNS期刊基本都有他的身影，儼然成為生命科學/基礎醫學領域的研究熱點。這不，今年1月還登上了Science子刊封面。
小編統計了近十年PubMed數據庫外泌體相關的文章(見下圖)，僅22年目前為止就有812篇相關文章；再看國自然基金增長趨勢，大家有沒有嗅到“外泌體趨勢”。
那么接下來就讓我們揭開外泌體神秘的面紗吧。
外泌體長什么樣
外泌體是胞外囊泡(EV)的一個子集，它是胞內多泡體與細胞膜融合后，釋放到細胞外并且能被受體細胞吸收的膜性小囊泡(直徑在30~150 nm，平均100nm)。它們攜帶核酸、蛋白質、脂質和代謝物，具有磷脂雙分子層結構。
外泌體長這樣(不好看哈)
外泌體生物學功能和臨床應用
俗話說“濃縮就是精華”，別看外泌體長得小，可是很有內涵的。
多種細胞在正常及病理狀態下均可分泌外泌體，DNA、RNA(siRNAs、miRNAs、lncRNA等)、脂質、代謝物以及蛋白質被封裝入外泌體中，外泌體將他們作為生理和病理信息傳遞給受體細胞參與細胞間通訊。這個“小東西”可是承擔著細胞間信號傳輸載體的重要任務。可參與到機體免疫應答、抗原提呈、細胞遷移、細胞分化、腫瘤侵襲等方方面面。
Exosomes: A cell-to-cell transit system in the human body with pleiotropic functions(Scienc;IF:47)
1、外泌體與癌癥
外泌體在腫瘤的發生、發展和轉移中起著至關重要的作用。外泌體可以誘導或促進腫瘤形成。例如：源自乳腺癌和前列腺癌細胞的外泌體通過轉移其miRNA誘導腫瘤(ref:PMID25446899; IF:31+)。來自轉移性乳腺癌細胞的外泌體 miR-200 增強了上皮間質轉化 (EMT) 和其他弱轉移性乳腺癌細胞的轉移(ref:PMID25401471; IF:14+)。
大多數研究中，癌細胞來源外泌體的基質細胞受體是癌癥相關成纖維細胞 (CAF) 和免疫細胞，它們在腫瘤微環境中相互動態調節。不同的癌細胞衍生的外泌體物質，如核酸、信號蛋白和代謝物，可以對基質細胞產生促腫瘤作用(ref:PMID25621950; IF:28+)。基質到癌細胞的外泌體交換也調節癌癥進展和轉移，e.g.成纖維細胞衍生的外泌體還通過誘導Wnt-PCP自分泌信號來刺激乳腺癌細胞的遷移(ref:PMID23260141; IF:41+)。
外泌體還與腫瘤微環境的血管生成和細胞外基質重塑有關，這是腫瘤生長和轉移擴散的關鍵步驟。e.g.來自缺氧膠質母細胞瘤 (GBM) 細胞的外泌體誘導內皮細胞的促血管生成過程和 GBM細胞增殖 (ref:PMID24735924; IF:31+)。
癌細胞脫落的外泌體會促進對各種化學治療劑和抗體的耐藥性。e.g.CAF衍生的外泌體 miR-21與卵巢癌細胞中的 APAF1結合賦予癌細胞對紫杉醇抗性(ref:PMID27021436; IF:14+)
。外泌體直接與治療劑相互作用并降低了它們對癌細胞的功效，或者是由于外泌體（主要來自CAF）改變了癌細胞的轉錄組以促進其存活。
Biogenesis and identification of exosomes(Scienc;IF:47)
2、外泌體作為癌癥的診斷和預后標志物
液體活檢相比組織活檢對患者造成的創傷性更小因而迅速受到關注。外泌體廣泛富集于人體的血液、乳汁、尿液、腦脊髓液以及唾液等多種體液中，它的脂質膜可保護其內容物免受體液中酶的損害，具有高度的穩定性。此外，外泌體中包含了特異性的腫瘤標志物。這些特點都使其成為癌癥液體活檢的新靶點。
圖片來源：https://sci-hub.se/10.1021/acsami.8b12725
藥物載體
外泌體是天然的分泌性膜囊泡，具有很好的耐受性，且毒性低，本身作為藥物有效載體進入到其它細胞中，因而具有潛在的藥物靶向遞送能力。使用外泌體遞送miRNA/siRNA的抗癌治療臨床前測試已用于嚙齒動物的乳腺癌、神經膠質瘤和胰腺癌(ref:PMID23032975; 23419525;29669940)。
外泌體諾貝爾獎封神之路
1974年，諾貝爾生理學或醫學獎授予Albrt Claude，Chrisyian de Duv，George E.Palade關于細胞機構和囊泡功能的相關發現。
1983年，外泌體首次于綿羊網織紅細胞中被發現。
1985年，諾貝爾生理學或醫學獎授予Michael S.Brown，Josph L.Goldstin，關于膽固醇代謝囊泡調控的研究成果。
1987年Johnstone將其命名為“exosome”
1999年，諾貝爾生理學或醫學獎授予Gunter Blobel,他進一步提出了分泌蛋白進入內質網的信號肽學說。
2013年，諾貝爾生理學或醫學獎授予James E.Rothman,Randy W.Schekman,Thomas C.Südhof三位科學家，表彰其在細胞間囊泡運輸調控機制領域作出突出貢獻
……
外泌體生信相關研究
近幾年由于在臨床上的巨大應用價值，其研究熱度持續攀升，成為科研熱點，相關論文發表數量呈爆炸式增長。目前，外泌體基于自測數據發文的一般的發文形式：1、新的分子標志物篩選 2、分子機制探索，例如：ceRNA機制。
小編特意找了下，基于公開數據研究外泌體的純生信文章寥寥無幾，原因可能是單個數據集樣本量及臨床信息不多、能挖的東西基本都分析過了再挖意義不大等。隨著外泌體研究越來越多涌現了很多外泌體開源數據，那么我們能利用這些數據做什么分析呢？
下面給大家展示一篇別人怎么基于公開數據做外泌體分析
主要結果：
1、收集癌癥外泌體marker（不區分），基于單細胞數據構建外泌體signature
2、預后signature的泛癌研究（TCGA）
3、免疫治療隊列分析
外泌體預后signature免疫浸潤研究
絮絮叨叨說了這么些，有人就問了，如果想研究外泌體，那么應該怎么做呢？不管是想盤活外泌體自測數據還是基于公開數據分析外泌體，一句話請聯系我們吧！
